Սոնիկը, Նաքլզը և Թեյլզը միավորվում են նոր հզոր հակառակորդի՝ Շեդոուի դեմ, որն առեղծվածային չարագործ է՝ ուժերով, որոնք նման չեն ոչնչի, ինչին նրանք երբևէ բախվել են։ Ուժերի անհամաչափության պատճառով Սոնիկի թիմը ստիպված է անսպասելի դաշինք ստեղծել՝ հույս ունենալով կանգնեցնել Շեդոուին և պաշտպանել մոլորակը։